Podatnicy oczekujący kontroli podatkowej często sami zauważają nieprawidłowości w swoich deklaracjach podatkowych, w związku z czym pojawia się pytanie, czy już po otrzymaniu zawiadomienia o zamiarze wszczęcia kontroli podatkowej mają oni jeszcze możliwość skorygowania swojej deklaracji i ewentualnego uregulowania zaległego podatku bez narażania się na sankcje karno-skarbowe.
Należy wskazać, że otrzymane zawiadomienie o zamiarze wszczęcia kontroli nie pozbawia podatnika możliwości złożenia korekty deklaracji za okres kontrolowany. Możliwość taka wyłączona jest jednak na czas trwania postępowania lub kontroli, w zakresie objętym tym postępowaniem lub kontrolą (korekty złożone przez podatników w tym czasie nie wywołują skutków prawnych). W świetle powyższego jest więc rekomendowane, aby podatnicy przygotowujący się do kontroli skorygowali jeszcze przed jej rozpoczęciem nieprawidłowości w swoich zeznaniach podatkowych.
O ile złożenie korekty deklaracji podatkowej wiązałoby się z obowiązkiem zapłacenia zaległego podatku, należy uiścić również należne odsetki za zwłokę. Ustawodawca preferencyjnie potraktował podatników składających korekty deklaracji wraz z uzasadnieniem przyczyn, umożliwiając im zapłatę odsetek za zwłokę w wysokości 75 proc. stawki podstawowej. Należy jednak zaznaczyć, że nie ma możliwości zastosowania tej obniżonej stawki w przypadku korekt dokonywanych przez podatników, którzy otrzymali już zawiadomienie o zamiarze wszczęcia kontroli podatkowej. W takiej sytuacji podatnicy tacy są zobligowani do uiszczenia odsetek za zwłokę wg standardowej stawki oprocentowania.
Podatnik ma więc co do zasady prawo do złożenia korekty deklaracji podatkowej po otrzymaniu zawiadomienia o wszczęciu kontroli podatkowej. Deklaracje mogą być przez niego korygowane do momentu rozpoczęcia postępowania kontrolnego. O ile taka korekta wiązałaby się z koniecznością uiszczenia zaległego podatku, nie ma możliwości do zastosowania preferencyjnej, obniżonej stawki odsetek za zwłokę.