Zmiany dotyczyć będą nieruchomości wykorzystywanych przez podatnika VAT na cele prowadzonej działalności gospodarczej, jak i dla celów prywatnych. Prawo do odliczenia podatku VAT od wydatków związanych z nieruchomością przysługiwać będzie do wysokości udziału procentowego w jakim dana nieruchomość jest i będzie wykorzystana do celów działalności prowadzonej przez podatnika. W takim przypadku odliczenie podatku naliczonego przysługiwać będzie tylko w części związanej z prowadzoną działalnością gospodarczą. W konsekwencji będzie istniał obowiązek określenia wysokości udziału procentowego, w jakim dana nieruchomość wykorzystywana jest do celów prowadzonej przez podatnika działalności gospodarczej.
Zmiana stopnia wykorzystywania nieruchomości dla celów działalności opodatkowanej będzie miała określone skutki. Ministerstwo Finansów zakłada bowiem dodanie art. 90a do ustawy o VAT, zgodnie z którym zmiana w stopniu wykorzystania nieruchomości do celów działalności gospodarczej w ciągu 120 miesięcy (a więc 10 lat) od momentu oddania jej do użytkowania, zobowiązywać będzie podatnika do dokonania korekty podatku naliczonego odliczonego przy nabyciu lub wytworzeniu nieruchomości. Korekty podatku odliczonego dokonywać się będzie w deklaracji za okres rozliczeniowy, w którym nastąpiła ta zmiana, w kwocie proporcjonalnej do pozostałego okresu korekty. Jeżeli podatnik wykorzystywać będzie nieruchomość w działalności gospodarczej również do czynności zwolnionych od VAT, korekta powinna uwzględniać proporcję określoną w art. 90 ust. 3-10 ustawy o VAT zastosowaną przez podatnika przy odliczeniu podatku naliczonego VAT.
W związku z powyższym, proponowane zmiany w ustawie o VAT będą polegać na modyfikacji ogólnej zasady dotyczącej prawa do odliczenia podatku VAT w przypadku, gdy nieruchomości nabyte do celów działalności gospodarczej nie są (bądź nie będą w przyszłości) wykorzystywane do celów związanych z tą działalnością.