Centralny rejestr faktur, pomysł budzący wiele kontrowersji może okazać się niewykonalny w praktyce, gdyż o ile możliwe jest zobowiązanie polskiego podatnika do przesyłania fiskusowi każdej faktury to problematyczne w egzekucji będzie wprowadzenie takiego obowiązku od podmiotów zagranicznych, będących poza polską jurysdykcją. Jedynym rozwiązaniem wydaje się zatem zobowiązanie polskiego nabywcy do przesyłania takich faktur do rejestru.

Wątpliwie wydaje się również stworzenie bezbłędnego systemu informatycznego, potrafiącego przetrzymać tak wielką ilość danych w sposób bezpieczny, zapewniający ich integralność treści i autentyczność (szacunkowo w Polsce wystawia się rocznie ponad 4 mld faktura i rachunków, kontrahenci zagraniczni wystawiają ponad. 1 mld, trudno oszacować ilość faktur i not korygujących)

Na zakończenie należy zadać pytanie – czy centralny rejestr faktur jest tak naprawdę potrzebny polskiemu systemowi podatkowemu i ile w rzeczywistości będzie on kosztował nasz budżet?