W praktyce, proces uzyskania akredytacji jest dość żmudny i długotrwały. Przed jej otrzymaniem wnioskodawca powinien udowodnić, że świadczy usługi na wysokim poziomie, dysponuje odpowiednimi środkami dydaktycznymi, posiada odpowiednio wykwalifikowaną kadrę, a także wystarczające warunki lokalowe do prowadzenia kształcenia i opracowuje stosowne materiały metodyczno-dydaktyczne. Uzyskanie akredytacji wiąże się także z kontrolą z kuratorium, która weryfikuje spełnienie wymaganych standardów. Wydanie akredytacji wymaga wniesienia opłaty, która obecnie wynosi około 900 zł. Sam proces od momentu złożenia wniosku do sporządzenia protokołu z kontroli oraz decyzji wojewódzkiego kuratora oświaty może trwać nawet kilka miesięcy.
Niestety z przepisów dotyczących wydawania akredytacji nie wynika jednoznacznie czy akredytacja wydana przedsiębiorstwu w jednym województwie jest ważna na terenie całego kraju. Sprawę komplikuje dodatkowo fakt, że akredytacje przyznawane są „placówkom”, a nie przedsiębiorstwom jako takim. Istnieje zatem ryzyko, że organy podatkowe przyjmą stanowisko, zgodnie z którym zwolnienie z VAT będzie obejmować jedynie usługi w zakresie akredytacji świadczonych na terenie danego województwa bądź jedynie w konkretnej placówce.